MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 65116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022443	ATT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022443	AC	4	8	148	155	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_022443	AC	3	6	234	239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022443	TG	3	6	307	312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022443	GTC	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_022443	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022443	TAA	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022443	TTA	2	6	415	420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022443	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022443	GT	3	6	444	449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022443	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022443	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636472
13	NC_022443	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636472
14	NC_022443	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636472
15	NC_022443	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636472
16	NC_022443	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636472
17	NC_022443	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636472
18	NC_022443	ACA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636472
19	NC_022443	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636472
20	NC_022443	AG	3	6	853	858	50 %	0 %	50 %	0 %	545636472
21	NC_022443	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636472
22	NC_022443	GGTT	2	8	987	994	0 %	50 %	50 %	0 %	545636472
23	NC_022443	ATGC	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	545636472
24	NC_022443	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636472
25	NC_022443	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636472
26	NC_022443	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636472
27	NC_022443	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636472
28	NC_022443	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636472
29	NC_022443	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636472
30	NC_022443	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636472
31	NC_022443	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636472
32	NC_022443	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545636472
33	NC_022443	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636472
34	NC_022443	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636472
35	NC_022443	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545636472
36	NC_022443	TA	3	6	1438	1443	50 %	50 %	0 %	0 %	545636472
37	NC_022443	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	545636472
38	NC_022443	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636472
39	NC_022443	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636472
40	NC_022443	A	6	6	1610	1615	100 %	0 %	0 %	0 %	545636472
41	NC_022443	A	7	7	1659	1665	100 %	0 %	0 %	0 %	545636472
42	NC_022443	AG	3	6	1714	1719	50 %	0 %	50 %	0 %	545636472
43	NC_022443	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636472
44	NC_022443	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636472
45	NC_022443	TCAT	2	8	1781	1788	25 %	50 %	0 %	25 %	545636472
46	NC_022443	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	545636472
47	NC_022443	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636472
48	NC_022443	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636472
49	NC_022443	TA	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022443	TAA	3	9	1920	1928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022443	T	6	6	1935	1940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022443	AC	3	6	2007	2012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_022443	CCA	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_022443	CTA	3	9	2088	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_022443	TA	3	6	2116	2121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022443	TA	4	8	2124	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022443	TAAT	2	8	2150	2157	50 %	50 %	0 %	0 %	545636473
58	NC_022443	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636473
59	NC_022443	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636473
60	NC_022443	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636473
61	NC_022443	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636473
62	NC_022443	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636473
63	NC_022443	A	7	7	2416	2422	100 %	0 %	0 %	0 %	545636473
64	NC_022443	ATTA	2	8	2470	2477	50 %	50 %	0 %	0 %	545636473
65	NC_022443	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	545636473
66	NC_022443	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636473
67	NC_022443	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	545636473
68	NC_022443	GACT	2	8	2692	2699	25 %	25 %	25 %	25 %	545636473
69	NC_022443	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636473
70	NC_022443	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636473
71	NC_022443	TAAA	2	8	2787	2794	75 %	25 %	0 %	0 %	545636473
72	NC_022443	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636473
73	NC_022443	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636473
74	NC_022443	TTTA	2	8	2848	2855	25 %	75 %	0 %	0 %	545636473
75	NC_022443	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636473
76	NC_022443	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636473
77	NC_022443	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	545636473
78	NC_022443	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636473
79	NC_022443	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636473
80	NC_022443	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636473
81	NC_022443	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636473
82	NC_022443	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636473
83	NC_022443	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636473
84	NC_022443	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636473
85	NC_022443	TTCA	2	8	3136	3143	25 %	50 %	0 %	25 %	545636473
86	NC_022443	AT	3	6	3151	3156	50 %	50 %	0 %	0 %	545636473
87	NC_022443	GATG	2	8	3157	3164	25 %	25 %	50 %	0 %	545636473
88	NC_022443	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636473
89	NC_022443	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636473
90	NC_022443	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636473
91	NC_022443	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636473
92	NC_022443	AATT	2	8	3261	3268	50 %	50 %	0 %	0 %	545636473
93	NC_022443	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022443	ATTA	2	8	3317	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022443	T	7	7	3340	3346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022443	GAAAA	2	10	3349	3358	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022443	A	6	6	3404	3409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022443	AATA	2	8	3428	3435	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022443	CCAA	2	8	3444	3451	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_022443	AAT	2	6	3452	3457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022443	GAG	2	6	3464	3469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022443	AGA	2	6	3555	3560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636474
103	NC_022443	AT	3	6	3567	3572	50 %	50 %	0 %	0 %	545636474
104	NC_022443	A	7	7	3581	3587	100 %	0 %	0 %	0 %	545636474
105	NC_022443	GAAA	2	8	3618	3625	75 %	0 %	25 %	0 %	545636474
106	NC_022443	AGTA	2	8	3677	3684	50 %	25 %	25 %	0 %	545636474
107	NC_022443	ACC	2	6	3686	3691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545636474
108	NC_022443	ATC	2	6	3704	3709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636474
109	NC_022443	TTG	2	6	3712	3717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636474
110	NC_022443	AGT	2	6	3735	3740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636474
111	NC_022443	GTAG	2	8	3825	3832	25 %	25 %	50 %	0 %	545636474
112	NC_022443	A	6	6	3837	3842	100 %	0 %	0 %	0 %	545636474
113	NC_022443	GAA	2	6	3906	3911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636474
114	NC_022443	GA	3	6	3931	3936	50 %	0 %	50 %	0 %	545636474
115	NC_022443	AGAA	2	8	3948	3955	75 %	0 %	25 %	0 %	545636474
116	NC_022443	A	6	6	3954	3959	100 %	0 %	0 %	0 %	545636474
117	NC_022443	TAG	2	6	3985	3990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022443	AAGG	2	8	4034	4041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022443	ACC	2	6	4060	4065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_022443	GGT	2	6	4076	4081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022443	AAT	2	6	4096	4101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022443	TA	3	6	4112	4117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022443	AAAT	2	8	4118	4125	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022443	TAA	2	6	4191	4196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022443	TTTAAA	2	12	4213	4224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022443	A	6	6	4281	4286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022443	A	6	6	4307	4312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022443	AATT	2	8	4317	4324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022443	A	7	7	4373	4379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022443	AT	3	6	4386	4391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022443	ATT	2	6	4417	4422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022443	AAG	2	6	4430	4435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636475
133	NC_022443	GTA	2	6	4438	4443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636475
134	NC_022443	ATT	2	6	4486	4491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636475
135	NC_022443	TGG	2	6	4497	4502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636475
136	NC_022443	ATTA	2	8	4536	4543	50 %	50 %	0 %	0 %	545636475
137	NC_022443	TTCT	2	8	4626	4633	0 %	75 %	0 %	25 %	545636475
138	NC_022443	TCAT	2	8	4637	4644	25 %	50 %	0 %	25 %	545636475
139	NC_022443	ATG	2	6	4696	4701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636476
140	NC_022443	A	6	6	4920	4925	100 %	0 %	0 %	0 %	545636476
141	NC_022443	AT	3	6	4973	4978	50 %	50 %	0 %	0 %	545636476
142	NC_022443	AGA	2	6	5009	5014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636476
143	NC_022443	CTC	2	6	5035	5040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545636476
144	NC_022443	GAC	2	6	5047	5052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636476
145	NC_022443	CTG	2	6	5083	5088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636476
146	NC_022443	AAT	2	6	5136	5141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636476
147	NC_022443	A	7	7	5167	5173	100 %	0 %	0 %	0 %	545636476
148	NC_022443	CAG	2	6	5202	5207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636476
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158	NC_022443	AG	4	8	5897	5904	50 %	0 %	50 %	0 %	545636477
159	NC_022443	ATA	2	6	5935	5940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636477
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179	NC_022443	AGA	2	6	6722	6727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636477
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189	NC_022443	TAGA	2	8	7183	7190	50 %	25 %	25 %	0 %	545636477
190	NC_022443	TGGA	2	8	7309	7316	25 %	25 %	50 %	0 %	545636477
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194	NC_022443	TGAAT	2	10	7478	7487	40 %	40 %	20 %	0 %	545636477
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198	NC_022443	TGAAC	2	10	7719	7728	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
199	NC_022443	AGG	2	6	7735	7740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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203	NC_022443	GTTATC	2	12	8041	8052	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	545636478
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205	NC_022443	ATGG	2	8	8085	8092	25 %	25 %	50 %	0 %	545636478
206	NC_022443	GCA	3	9	8100	8108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636478
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236	NC_022443	AGTT	2	8	9148	9155	25 %	50 %	25 %	0 %	545636478
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248	NC_022443	AATA	2	8	9650	9657	75 %	25 %	0 %	0 %	545636478
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256	NC_022443	GTAATG	2	12	9997	10008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636478
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258	NC_022443	GAA	2	6	10035	10040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636478
259	NC_022443	ATT	2	6	10071	10076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636478
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262	NC_022443	AGA	2	6	10181	10186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636478
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265	NC_022443	TGAT	2	8	10300	10307	25 %	50 %	25 %	0 %	545636478
266	NC_022443	AGA	2	6	10310	10315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636478
267	NC_022443	ATG	2	6	10318	10323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636478
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269	NC_022443	ACA	2	6	10379	10384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636478
270	NC_022443	ATC	2	6	10385	10390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636478
271	NC_022443	AGATGA	2	12	10391	10402	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	545636478
272	NC_022443	AAT	2	6	10405	10410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636478
273	NC_022443	A	7	7	10411	10417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_022443	TGG	2	6	10548	10553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636479
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291	NC_022443	TAT	2	6	11388	11393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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382	NC_022443	ATA	2	6	14882	14887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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390	NC_022443	GTAGG	2	10	15141	15150	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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392	NC_022443	ATG	2	6	15155	15160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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398	NC_022443	GTAT	2	8	15337	15344	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
399	NC_022443	TGT	2	6	15369	15374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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401	NC_022443	T	6	6	15413	15418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
402	NC_022443	TA	3	6	15425	15430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
403	NC_022443	AGG	2	6	15446	15451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
404	NC_022443	ACA	2	6	15463	15468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636482
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406	NC_022443	TA	3	6	15603	15608	50 %	50 %	0 %	0 %	545636482
407	NC_022443	TGC	2	6	15615	15620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636482
408	NC_022443	TAT	2	6	15627	15632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636482
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410	NC_022443	AT	3	6	15921	15926	50 %	50 %	0 %	0 %	545636482
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452	NC_022443	TAAATC	2	12	17902	17913	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
453	NC_022443	AAT	2	6	17941	17946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_022443	CA	3	6	17964	17969	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
455	NC_022443	TTA	2	6	18015	18020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_022443	ATA	2	6	18084	18089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_022443	ATT	2	6	18224	18229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636485
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500	NC_022443	AG	3	6	20240	20245	50 %	0 %	50 %	0 %	545636486

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